class: title-slide, middle, center background-image: url(data:image/png;base64,#figures/HelloWorld_slide1.png) background-position: 90% 75%, 75% 75%, center background-size: 1210px,210px, cover .center-column[ # VieRnes de Bioinformática en el LIIGH ### ⚔<br/>Sesión informativa ####Dra. Evelia Coss #### 6/febrero/2026 ] .left[.footnote[R-Ladies Theme[R-Ladies Theme](https://www.apreshill.com/project/rladies-xaringan/)]] --- ## Como inicio esta idea ... .pull-left[ Los principales pilares de los Viernes de Bioinformática: - Retribuir - Tiempo - Conocimiento - Paciencia - Solidaridad - Gratitud ] .pull-right[ > Si he visto más lejos es porque estoy sobre los hombros de gigantes > — Isaac Newton. ] -- .center[ .content-box-blue[ Gracias a cada persona que ha sido parte de este camino. Este espacio es nuestra manera de **aprender, compartir y crecer juntos**. ]] --- background-image: url(data:image/png;base64,#figures/liigh_unam_logo.png) background-position: 10% 10% background-size: 10% class: middle, center <img src="data:image/png;base64,#figures/logo.png" alt="Logo LIIGH" width="150" /> # VieRnes de Bioinformática en el LIIGH ---- **Objetivo**: Fomentar la formación y crecimiento en bioinformática a través de *cursos gratuitos* para toda la *comunidad interesada*. --- ## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM .pull-left[ - Fundado en septiembre 2023 - Organizadores: Dra. Evelia Coss y Dr. Israel Aguilar - STAFF: Jorge Suazo - **Impacto internacional** con participantes de países como: Argentina, Bolivia, Chile, Colombia, Costa Rica, El Salvador, Ecuador, Perú, Venezuela, Guatemala, España y Estados Unidos. Redes sociales: - Página web: https://viernesbioinformatica.github.io/ [
](https://github.com/VieRnesBioinformatica) [
](https://www.youtube.com/@viernesdebioinfoliigh) ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" width="80%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- ## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM .pull-left[ Material y grabaciones: - VieRnes de Bioinformática [Parte 0](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2023) - (22 sep - 9 dic, 2023) - VieRnes de Bioinformática [Parte 1](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024) - (2 feb - 2 de agosto, 2024) - VieRnes de Bioinformática [Parte 2](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024_parte2) - (7 sep - 6 de dic, 2024) - VieRnes de Bioinformática [Parte 3](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte3) - (7 feb - 6 de junio, 2025) - VieRnes de Bioinformática [Parte 4](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4) - (5 sep - 9 de dic, 2025) ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" width="80%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- ## Temas .pull-left[ - Introducción a **R, Python y Bash** - Manipulación de datos (vector, dataframe, matriz) - El ABC de las **funciones y loops** - Introducción a **Quarto y Rmarkdown** - Visualizaciones graficas con **ggplot2** - **Git + Github** - **Bioestadistica** - **Buenas practicas** en bioinformática - Preparación de data para **GWAS** - **PCA** en Transcriptómica - Predicción **miRNAs** - EcoNiches ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/allison-horst-code-kitchen.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- ## Workshops .pull-left[ - Workshop. Análisis de datos de **RNA-Seq** (parte 0) - Nexflow (parte 1) - Bases para la inferencia **filogenética**, construcción, lectura e interpretación de árboles filogenéticos (parte 2) - Mini curso de **metagenómica** (parte 3) - Llamado de **variantes genéticas** (parte 3) - **Leaving Academia** - Mi camino profesional tras dejar la academia (parte 4) ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/rmarkdown_wizards.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- ## Proyectos de la Comunidad .pull-left[ - **Dr. Jose Luis Tellez** - *C. elegans* como modelo de estudio de enfermedades raras y resistencia a antiparasitarios - **Dr. Diego Cortes** - Reducción del cromosoma Y | Tortugas, lagartijas - **Dr. Claudia Gonzaga** - Enfermedades raras | Variantes estructurales - **Dr. Federico Sánchez** - Explorando la historia evolutiva y la genética poblacional en México a través de datos paleogenómicos ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/debugging.jpg" width="100%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- ## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM (Parte 4) - 5 sep - 9 de dic, 2025 - Obtuvimos más de 317 soliictudes distribuidos en: **66.6% México, 14.2% Perú, 10.1% Colombia, 5% Ecuador, 1.6% Bolivia, 0.6% Argentina, 0.3%. Uruguay, Chile, Venezuela, Guatemala, España, Estados Unidos, Italia, Brasil, Nicaragua,** y **El Salvador**. .pull-left[ - Rango de edad: **18 a 64 años** - 10% de los registros corresponden a **profesores investigadores**, 19.9% estudiantes de **doctorado**, 19.2% **maestría**, 21.1% **licenciatura**. - Alcanzamos a **166 personas** a través de *Youtube y Google meet*. ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/VieRnesBioinfo_youtube.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- class: center, middle
# Próxima clase: 20 feb - 19 junio, 2026 ## VieRnes de Bioinformática [Parte 5](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2026_parte5) ### 16 clases --- ## STAFF: VieRnes de Bioinformática en el LIIGH <div style="display:flex; justify-content:center; align-items:center;"> <div style="display:flex; justify-content:space-around; width:80%; text-align:center;"> <div> <img src="figures/EveCoss.jpg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br> <b>Evelia Coss</b><br> Coordinadora<br>Instructora </div> <div> <img src="figures/IsraelAguilar.jpg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br> <b>Israel Aguilar</b><br> Coordinador<br>Instructor </div> <div> <img src="figures/JorgeSuazo.jpeg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br> <b>Jorge Suazo</b><br> Desarrollo web<br>Instructor </div> <div> <img src="figures/DanielaRobles.png" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br> <b>Daniela Robles</b><br> Coordinadora<br>LIIGH </div> </div> </div> <img src="data:image/png;base64,#figures/webeliveinyou.png" width="50%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## VieRnes de Bioinformática (Parte 5) .pull-left[ Temas: - Introducción a **R** - Manipulación de datos (vector y dataframe) - El ABC de las **funciones** - Documentación con roxygen - stringr - Introducción a **Quarto** (paginas web) - Crear presentaciones con **Rmarkdown** - **Estadística** para datos biológicos - Visualizaciones graficas con **ggplot2** y **ComplexHeatmap** ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/ggplot2_masterpiece.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- ## Workshops .pull-left[ - **Workshop. Predicción estructural de proteínas** + *Fechas*: 28 y 30 de abril; 5 y 7 de mayo (martes y jueves) + *Duración*: 4 horas por sesión + *Modalidad*: híbrida (15 personas presencial / 25 virtuales) + *Incluye*: coffee break y comida + *Lugar*: LIIGH-UNAM - **The Carpentries: Capacitación de instructures** + 2da versión en español + *Fechas*: Noviembre + *Modalidad*: Presencial + *Lugar*: LIIGH-UNAM ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/horst_rstudio_air.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- class: inverse, center, middle
# Comunidades bioinformáticas sin fronteras ### Evelia Lorena Coss-Navarrete, Erika Viridiana Cruz Bonilla y Nelly Sélem Mojica #### Biotecnología en movimiento, 2025 #### <https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html> --- <img src="data:image/png;base64,#figures/bioinfo1.png" width="60%" style="display: block; margin: auto;" /> .left[.footnote[.black[ Imagen tomada de: [Comunidades bioinformáticas sin fronteras](https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html) ]]] --- ## Organizaciones gratuitas de difusión .pull-left[ <img src="data:image/png;base64,#figures/bioinfo3.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" /> ] .pull-right[ - [**ISCB-RSG-México**](https://rsg-mexico.iscbsc.org/): Grupo estudiantil, cursos gratuitos y journal club. - [**The Carpentries**](https://carpentries.org/): Cursos gratuitos y capacitaciones de instructores. - [**ISCB Wikipedia - más allá del inglés**](https://en.wikipedia.org/wiki/Wikipedia:WikiProject_Molecular_Biology/Computational_Biology/14th_ISCB_Wikipedia_competition_entries): Mejorar la calidad y cantidad de información disponible en Wikipedia. - [**R-Ladies Morelia**](https://www.facebook.com/p/R-Ladies-Morelia-100093337606435/): Cursos gratuitos para promover la participación de mujeres y personas de géneros subrepresentados. - [**El MUMAT**](https://mumat.matcuer.unam.mx/): Museo Virtual de Matemáticas. ] .left[.footnote[.black[ Imagen tomada de: [Comunidades bioinformáticas sin fronteras](https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html) ]]] --- .center[ .content-box-blue[ Gracias a cada persona que ha sido parte de este camino. Este espacio es nuestra manera de **aprender, compartir y crecer juntos**. ]] .left-col[ **STAFF** - Dra. Evelia Coss - Dr. Israel Aguilar - Jorge Alfredo Suazo **Coordinación del LIIGH** - Dra. Daniela Robles - Dr. Federico Sánchez - Dra. María C. Ávila Arcos - Dra. Alejandra Medina - Eglee Lomelin - Luis Aguilar - Jair Santiago García ] .center-col[ **Instructores** - Sofia Salazar - Dr. Domingo Martínez - Dr. Obed Ramirez - Dr. Shaday Guerrero - Dra. Haydeé Peruyero - Dra. Joselyn Chávez - Oscar Aldana - Alejandra Schafer - Jazmín López Chacón - Quetzally Medina - Jorge Alfredo Suazo - Maria Fernanda Miron Toruno - Dra. Aline Pingarroni - Sofía Zorrilla Azcué ] .right-col[ - Maria Jose Palma Martinez - Johana Galguera - Dr. David Valle García - Angélica de Luna García - Brenda Eloisa Sanchez Pichardo - María Guadalupe Segovia Ramírez - Alejandra Paulina Pérez González - Josué Guzmán Linares - Andrea Maria Torres Iribe - Karla Guzmán Barrenechea - Dr. Alan Michael Torres Calderon - Armando Sunny ] --- ## Recordatorio: Evento Social .pull-left[ Viernes 6 de febrero, 15:45h - **Partido amistoso de Fútbol** + Cancha del campus - **Mario Kart Wii** + Área de encuentro académico - **Juegos de Mesa** + Aula 3 - **Búsqueda del Tesoro** + Entrada del LIIGH ] .pull-right[ <img src="data:image/png;base64,#figures/Rproject.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- class: center, middle
## Gracias por su atención Respira y coméntame tus dudas. <img src="data:image/png;base64,#figures/cat.png" width="20%" style="display: block; margin: auto 0 auto auto;" />