VieRnes de Bioinformática en el LIIGH

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####Dra. Evelia Coss 
#### 6/febrero/2026
]

.left[.footnote[R-Ladies Theme[R-Ladies Theme](https://www.apreshill.com/project/rladies-xaringan/)]]

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## Como inicio esta idea ...

Los principales pilares de los Viernes de Bioinformática:

- Retribuir
- Tiempo
- Conocimiento
- Paciencia
- Solidaridad
- Gratitud
]

.pull-right[
> Si he visto más lejos es porque estoy sobre los hombros de gigantes 
> — Isaac Newton.

]

.center[
.content-box-blue[
Gracias a cada persona que ha sido parte de este camino. 
Este espacio es nuestra manera de **aprender, compartir y crecer juntos**.
]]

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# VieRnes de Bioinformática en el LIIGH
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**Objetivo**: Fomentar la formación y crecimiento en bioinformática a través de *cursos gratuitos* para toda la *comunidad interesada*.

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## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM

.pull-left[
- Fundado en septiembre 2023
- Organizadores: Dra. Evelia Coss y Dr. Israel Aguilar
- STAFF: Jorge Suazo
- **Impacto internacional** con participantes de países como: Argentina, Bolivia, Chile, Colombia, Costa Rica, El Salvador, Ecuador, Perú, Venezuela, Guatemala, España y Estados Unidos.

Redes sociales:

- Página web: https://viernesbioinformatica.github.io/

[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:2em;width:1.94em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg>](https://github.com/VieRnesBioinformatica) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 576 512" style="height:2em;width:2.25em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M549.655 124.083c-6.281-23.65-24.787-42.276-48.284-48.597C458.781 64 288 64 288 64S117.22 64 74.629 75.486c-23.497 6.322-42.003 24.947-48.284 48.597-11.412 42.867-11.412 132.305-11.412 132.305s0 89.438 11.412 132.305c6.281 23.65 24.787 41.5 48.284 47.821C117.22 448 288 448 288 448s170.78 0 213.371-11.486c23.497-6.321 42.003-24.171 48.284-47.821 11.412-42.867 11.412-132.305 11.412-132.305s0-89.438-11.412-132.305zm-317.51 213.508V175.185l142.739 81.205-142.739 81.201z"/></svg>](https://www.youtube.com/@viernesdebioinfoliigh)

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" width="80%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM

- VieRnes de Bioinformática [Parte 0](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2023) - (22 sep - 9 dic, 2023) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 1](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024) - (2 feb - 2 de agosto, 2024) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 2](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024_parte2) - (7 sep - 6 de dic, 2024) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 3](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte3) - (7 feb - 6 de junio, 2025) 
- VieRnes de Bioinformática [Parte 4](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4) - (5 sep - 9 de dic, 2025) 
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" width="80%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## Temas

.pull-left[
- Introducción a **R, Python y Bash**
- Manipulación de datos (vector, dataframe, matriz)
- El ABC de las **funciones y loops**
- Introducción a **Quarto y Rmarkdown**
- Visualizaciones graficas con **ggplot2**
- **Git + Github**
- **Bioestadistica**
- **Buenas practicas** en bioinformática
- Preparación de data para **GWAS**
- **PCA** en Transcriptómica
- Predicción **miRNAs**
- EcoNiches
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/allison-horst-code-kitchen.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## Workshops

.pull-left[
- Workshop. Análisis de datos de **RNA-Seq** (parte 0)
- Nexflow (parte 1)
- Bases para la inferencia **filogenética**, construcción, lectura e interpretación de árboles filogenéticos (parte 2)
- Mini curso de **metagenómica** (parte 3)
- Llamado de **variantes genéticas** (parte 3)
- **Leaving Academia** - Mi camino profesional tras dejar la academia (parte 4)
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/rmarkdown_wizards.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## Proyectos de la Comunidad

.pull-left[
- **Dr. Jose Luis Tellez** - *C. elegans* como modelo de estudio de enfermedades raras y resistencia a antiparasitarios
- **Dr. Diego Cortes** - Reducción del cromosoma Y | Tortugas, lagartijas 
- **Dr. Claudia Gonzaga** - Enfermedades raras | Variantes estructurales
- **Dr. Federico Sánchez** - Explorando la historia evolutiva y la genética poblacional en México a través de datos paleogenómicos
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/debugging.jpg" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM (Parte 4)

- 5 sep - 9 de dic, 2025
- Obtuvimos más de 317 soliictudes distribuidos en: **66.6% México, 14.2% Perú, 10.1% Colombia, 5% Ecuador, 1.6% Bolivia, 0.6% Argentina, 0.3%. Uruguay, Chile, Venezuela, Guatemala, España, Estados Unidos, Italia, Brasil, Nicaragua,** y **El Salvador**.

.pull-left[
- Rango de edad: **18 a 64 años**
- 10% de los registros corresponden a **profesores investigadores**, 19.9%
estudiantes de **doctorado**, 19.2% **maestría**, 21.1% **licenciatura**.
- Alcanzamos a **166 personas** a través de *Youtube y Google meet*.

]

]

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## STAFF: VieRnes de Bioinformática en el LIIGH

<div style="display:flex; justify-content:center; align-items:center;">
  <div style="display:flex; justify-content:space-around; width:80%; text-align:center;">
    <div>
      <img src="figures/EveCoss.jpg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Evelia Coss</b><br>
      Coordinadora<br>Instructora
    </div>
    <div>
      <img src="figures/IsraelAguilar.jpg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Israel Aguilar</b><br>
      Coordinador<br>Instructor
    </div>
    <div>
      <img src="figures/JorgeSuazo.jpeg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Jorge Suazo</b><br>
      Desarrollo web<br>Instructor
    </div>
    <div>
      <img src="figures/DanielaRobles.png" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Daniela Robles</b><br>
      Coordinadora<br>LIIGH
    </div>
  </div>
</div>

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## VieRnes de Bioinformática (Parte 5)

- Introducción a **R**
- Manipulación de datos (vector y dataframe)
- El ABC de las **funciones**
- Documentación con roxygen
- stringr
- Introducción a **Quarto** (paginas web)
- Crear presentaciones con **Rmarkdown**
- **Estadística** para datos biológicos
- Visualizaciones graficas con **ggplot2** y **ComplexHeatmap**
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ggplot2_masterpiece.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## Workshops

.pull-left[
- **Workshop. Predicción estructural de proteínas**
  + *Fechas*: 28 y 30 de abril; 5 y 7 de mayo (martes y jueves)
  + *Duración*: 4 horas por sesión
  + *Modalidad*: híbrida (15 personas presencial / 25 virtuales)
  + *Incluye*: coffee break y comida
  + *Lugar*: LIIGH-UNAM

- **The Carpentries: Capacitación de instructures**
  + 2da versión en español
  + *Fechas*: Noviembre
  + *Modalidad*: Presencial
  + *Lugar*: LIIGH-UNAM

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/horst_rstudio_air.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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.left[.footnote[.black[
Imagen tomada de: [Comunidades bioinformáticas sin fronteras](https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html)
]]]

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## Organizaciones gratuitas de difusión

<img src="data:image/png;base64,#figures/bioinfo3.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

.pull-right[
- [**ISCB-RSG-México**](https://rsg-mexico.iscbsc.org/): Grupo estudiantil, cursos gratuitos y journal club. 
- [**The Carpentries**](https://carpentries.org/): Cursos gratuitos y capacitaciones de instructores.
- [**ISCB Wikipedia - más allá del inglés**](https://en.wikipedia.org/wiki/Wikipedia:WikiProject_Molecular_Biology/Computational_Biology/14th_ISCB_Wikipedia_competition_entries): Mejorar la calidad y cantidad de información disponible en Wikipedia.
- [**R-Ladies Morelia**](https://www.facebook.com/p/R-Ladies-Morelia-100093337606435/): Cursos gratuitos para promover la participación de mujeres y personas de géneros subrepresentados. 
- [**El MUMAT**](https://mumat.matcuer.unam.mx/): Museo Virtual de Matemáticas.
]

.left[.footnote[.black[
Imagen tomada de: [Comunidades bioinformáticas sin fronteras](https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html)
]]]

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.center[
.content-box-blue[
Gracias a cada persona que ha sido parte de este camino. 
Este espacio es nuestra manera de **aprender, compartir y crecer juntos**.
]]

**STAFF**

- Dra. Evelia Coss
- Dr. Israel Aguilar
- Jorge Alfredo Suazo

**Coordinación del LIIGH**

- Dra. Daniela Robles 
- Dr. Federico Sánchez
- Dra. María C. Ávila Arcos 
- Dra. Alejandra Medina
- Eglee Lomelin 
- Luis Aguilar
- Jair Santiago García

]

.center-col[
**Instructores**
- Sofia Salazar
- Dr. Domingo Martínez
- Dr. Obed Ramirez
- Dr. Shaday Guerrero
- Dra. Haydeé Peruyero 
- Dra. Joselyn Chávez 
- Oscar Aldana
- Alejandra Schafer
- Jazmín López Chacón
- Quetzally Medina
- Jorge Alfredo Suazo 
- Maria Fernanda Miron Toruno 
- Dra. Aline Pingarroni 
- Sofía Zorrilla Azcué
]

.right-col[
- Maria Jose Palma Martinez
- Johana Galguera
- Dr. David Valle García
- Angélica de Luna García
- Brenda Eloisa Sanchez Pichardo
- María Guadalupe Segovia Ramírez
- Alejandra Paulina Pérez González
- Josué Guzmán Linares
- Andrea Maria Torres Iribe
- Karla Guzmán Barrenechea
- Dr. Alan Michael Torres Calderon
- Armando Sunny
]

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## Recordatorio: Evento Social

- **Partido amistoso de Fútbol**
  + Cancha del campus
  
- **Mario Kart Wii**
  + Área de encuentro académico
  
- **Juegos de Mesa**
  + Aula 3
  
- **Búsqueda del Tesoro**
  + Entrada del LIIGH
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/Rproject.png" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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Respira y coméntame tus dudas.